Como organismo asesor de la Justicia, la labor del Servicio Médico Legal se centra en realizar pericias de alto nivel a través de sus distintos Departamentos y especialidades. Su quehacer se centra en cuatro grandes áreas: Tanatología, Clínica, Laboratorios y Salud Mental. Además responde a materias específicas como de identificación forense en fallecidos de larga data, ya sean casos asociados a víctimas de violaciones a los derechos humanos, situaciones de emergencia y desastres masivos o en materias criminales.